Micro-organismes en agriculture : nouvelles découvertes 🇪🇺🇩🇰

Vidéos - Pierre Girard (2023-04-07) - Mette Vestergård Madsen Louise Reinbach Rasmussen Søren Ilsøe - Durée : 10 minutes

Grandes cultures Micro-organismes Agriculture Durabilité Microbiote Pesticides

Cette vidéo explore le rôle fondamental des micro-organismes dans l'agriculture, en s'appuyant sur l'expertise de Mette Vestergård Madsen, Louise Reinbach Rasmussen et Søren Ilsøe. Les intervenants mettent en lumière la diversité et l'activité invisible des milliards d'êtres vivants peuplant nos sols, essentiels à la santé des cultures. Ils soulignent l'importance de maintenir un environnement stable pour ces populations, notamment en évitant le labour, qui perturbe les strates biologiques du sol. La discussion aborde également le concept d'holobionte, où plante et micro-organismes forment un système intégré. Si l'usage d'intrants comme le glyphosate demeure une préoccupation majeure pour l'équilibre microbien, la recherche progresse pour trouver des alternatives durables. En conclusion, les experts appellent à une meilleure collaboration entre la science et les agriculteurs, afin d'optimiser ces interactions biologiques naturelles et d'assurer une agriculture résiliente face aux défis environnementaux futurs.

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Résumé

Cette vidéo explore le rôle fondamental des micro-organismes dans l'agriculture, en s'appuyant sur l'expertise de Mette Vestergård Madsen, Louise Reinbach Rasmussen et Søren Ilsøe. Les intervenants mettent en lumière la diversité et l'activité invisible des milliards d'êtres vivants peuplant nos sols, essentiels à la santé des cultures. Ils soulignent l'importance de maintenir un environnement stable pour ces populations, notamment en évitant le labour, qui perturbe les strates biologiques du sol. La discussion aborde également le concept d'holobionte, où plante et micro-organismes forment un système intégré. Si l'usage d'intrants comme le glyphosate demeure une préoccupation majeure pour l'équilibre microbien, la recherche progresse pour trouver des alternatives durables. En conclusion, les experts appellent à une meilleure collaboration entre la science et les agriculteurs, afin d'optimiser ces interactions biologiques naturelles et d'assurer une agriculture résiliente face aux défis environnementaux futurs.

Le microbiote pour une agriculture plus durable ? Les micro-organismes des plantes (bactéries et champignons) ont développé certains mécanismes pour protéger les plantes. Car celles-ci leur permettent de se nourrir et de vivre. Partout en Europe, des scientifiques tentent de décrypter le microbiote des plantes, qui pourrait permettre de se passer de certains produits phytosanitaires. Visite à l’université d’Aarhus, membre de l’Alliance européenne de recherche pour une agriculture sans pesticides, et sur une ferme pionnière en agriculture de conservation des sols.

Cette vidéo est co-produite par INRAE, l’Institut national de recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement.

Membre de l’Alliance européenne de recherche vers une agriculture sans pesticides, l’université d’Aarhus participe au projet Horizon Europe BarleyMicroBreed qui vise à améliorer la résistance des plantes à la sécheresse en exploitant l'interaction entre l'orge et son microbiome racinaire.

BarleyMicroBreed repose sur le paradigme selon lequel des interactions optimisées entre les racines des plantes et le microbiote du sol existant peuvent améliorer l'efficacité des ressources des plantes cultivées et leur résistance à la sécheresse.

Ce projet est le fruit d'une collaboration entre l'université d'Aarhus, l'université de Copenhague (Danemark), BOKU (Autriche), ICARDA (Liban), MetasysX (Allemagne), Photon Systems Instruments (République tchèque), Eurofins Genomics (Allemagne) et Lantmannen (Suède).

Cette vidéo au Danemark est la septième étape de mon « Field Trip », mon tour d’Europe de la recherche scientifique en agronomie.

L’Alliance européenne de recherche vers une agriculture sans pesticides a vu le jour à l’initiative d’INRAE et de ses homologues allemands ZALF et JKI. Elle réunit 34 organismes de recherche issus de 20 pays européens, désireux d’unir leurs forces et de faciliter les échanges de connaissances et d’expertises. Elle vise à accompagner scientifiquement l’objectif ambitieux fixé par la Commission européenne de réduire de moitié l’utilisation des pesticides d’ici 2030.

Le site de l’alliance et des 34 membres :

https://www.era-pesticidefree.eu/About-us

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La liste des intervenant·e·s de cette vidéo (par ordre d’apparition) :

• Mette Vestergård Madsen : écologie microbienne et phytopathologie, département d’agroécologie, Université d’Aarhus

• Louise Reinbach Rasmussen : technicienne de laboratoire, département d’agroécologie, Université d’Aarhus

• Søren Ilsøe : agriculteur, pionnier de l’agriculture de conservation des sols, Ferme Knudstrup à Fjenneslev

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Mon impact transport :

Je suis très attentif à limiter mon bilan carbone. Pour cette vidéo, mon impact transport (source : Ademe/monimpacttransport.fr) est de 3,2 kg CO2e pour parcourir 1352 km en train et 19 kg CO2e pour les 86 km restants en voiture, soit 176,8 kg CO2e de moins que si j’avais opté pour la voiture exclusivement et 250,8 kg CO2e de moins que l’avion.

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Une série de Pierre Girard, co-produite avec INRAE

Auteur :

Pierre Girard

Caméra et montage :

Patryk Puchalski

Graphisme :

Otto Stobbe

Traduction et sous-titrage :

Geoffrey Schöning

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1. FieldTrip_EU

La vie invisible des sols : une exploration scientifique

Partout autour de nous, dans l’air, sur notre peau, sur les feuilles et surtout dans le sol, se cache une multitude d’organismes vivants. Bien que le champ semble calme à l’œil nu, il abrite des milliards de micro-organismes silencieux mais extrêmement actifs. Mette Vestergård Madsen et Louise Reinbach Rasmussen soulignent que ces êtres, invisibles sans grossissement (jusqu’à 200 fois au microscope), forment une foule immense autour des racines et au sein des particules de terre.

Diversité et rôle des micro-organismes

Les bactéries sont des millions de fois plus petites que les insectes, comme les pucerons, mais leur importance est capitale. Leur diversité fonctionnelle leur permet de dégrader presque n’importe quelle [[matière organique]]. Malgré leur apparente simplicité en tant que cellules uniques, elles possèdent un appareil physiologique complexe capable d’accomplir des tâches variées dans des conditions environnementales extrêmes.

L’impact des pratiques culturales sur l’écosystème du sol

Søren Ilsøe explique que les agriculteurs sont de plus en plus conscients de ce monde invisible. Pour lui, le travail du sol est déterminant : - Le labour crée un bouleversement complet des populations, mélangeant des bactéries aérobies (qui aiment l’oxygène) et anaérobies. - À l’inverse, maintenir le sol couvert et limiter le labour permet de stabiliser les populations microbiennes dans les différents horizons du sol.

Concernant l’utilisation des produits phytosanitaires, comme le glyphosate, le débat reste ouvert. Si ces produits ont des effets antibiotiques potentiels sur la vie du sol, les agriculteurs cherchent des alternatives pour réduire leur usage tout en protégeant la compétitivité des cultures. La recherche de substituts doit impérativement veiller à ne pas endommager davantage la biologie souterraine.

Le concept d’holobionte

La notion d’holobionte est centrale dans les nouvelles découvertes agronomiques. Elle définit un organisme hôte (comme une plante ou un humain) vivant en association étroite avec ses micro-organismes, formant ainsi un « superorganisme ».

Plutôt que d’ajouter systématiquement des micro-organismes exogènes au sol, les chercheurs comme Mette Vestergård Madsen et Louise Reinbach Rasmussen préconisent de favoriser la synergie entre la plante et la biodiversité microbienne déjà présente. L’objectif est d’optimiser les performances naturelles des plantes.

Vers une agriculture de précision biologique

Le changement de mentalité est en cours. De nombreux agriculteurs expérimentent déjà des techniques comme [[le [[thé de compost]]]], bien que ces pratiques restent encore très expérimentales. Le domaine nécessite davantage de recherches pour comprendre précisément les mécanismes à l’œuvre.

Il existe un paradoxe saisissant : alors que l’humanité cherche à peupler Mars, nous commençons à peine à explorer la complexité biologique située littéralement sous nos pieds. L’avenir de l’agriculture réside sans aucun doute dans cette capacité à mieux exploiter et respecter ces écosystèmes invisibles.